科研产出
基于SLAF-Seq技术的辣椒抗炭疽病QTL定位分析及SSR分子标记开发
《南方农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：【目的】利用SLAF-Seq技术对辣椒抗炭疽病QTL进行定位分析，开发与炭疽病抗性QTL紧密连锁的分子标记，为辣椒抗炭疽病分子标记辅助选择育种提供理论参考。【方法】以抗病材料PPTC26-3-1-1-1-1-1和感病材料1287为亲本构建F2代群体，并采用SLAF-Seq技术进行分子标记开发，构建高密图遗传连锁图谱。结合表型数据，利用复合区间作图法（CIM）对辣椒果实转色期的炭疽病抗性进行QTL分析。利用Microsatellite（MISA）在定位区间识别SSR位点。【结果】从亲本和子代样品共获得423351627条Reads，其中，来自PPTC26-3-1-1-1-1-1和1287分别为8130516和6621396条，F2代群体120个子代样品的平均Reads数量为34049987个。构建包含4671个SNP分子标记、分布于12个连锁群、总图距为1567.53 c M、平均图距为0.34 c M的辣椒高密度遗传图谱，检测到1个炭疽病抗性相关的QTL（Ca R10.1），位于10号连锁群上187930592～189766111 bp物理区间内。共有23个基因定位在关联区域内，根据基因功能注释，其中1个基因编码假定晚疫病抗性蛋白同源物R1B-23异构体X2,1个基因编码PPR蛋白，可能与辣椒果实转色期炭疽病抗性相关。在关联到的QTL区间内开发出SSR分子标记T482，在F2代群体中的验证结果显示，T482引物在F2代群体单株中扩增结果与表型鉴定结果一致。F2代群体抗病和中抗单株中有53株具有抗病亲本的条带，有25株同时具有抗病亲本和感病亲本的条带；F2代群体感病单株中，有42株具有感病亲本的条带。【结论】构建高密度遗传连锁图谱，将辣椒果实转色期炭疽病抗性定位于10号连锁群，在关联区间开发出SSR分子标记T482，可初步鉴别辣椒果实转色期炭疽病抗性，同时结合针刺接种法鉴定，可提高鉴定的准确率。
关键词： 辣椒 SLAF-Seq 遗传图谱 炭疽病 QTL SSR分子标记
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辣椒果实颜色性状与SSR分子标记的关联分析及指纹图谱构建
《生物技术通报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：[目的]对辣椒种质材料进行遗传多样性分析,挖掘与果实颜色性状关联的分子标记.[方法]以57份辣椒种质为供试材料,利用7个果实颜色性状与20个SSR标记进行遗传多样性分析,使用Tassel 5.0软件的一般线性模型(GLM)和混合线性模型(MLM)进行SSR标记和性状的关联分析,并构建种质指纹图谱.[结果]7个果实颜色性状遗传多样性指数变幅为1.58(果皮L值)-2.08(果肉a值),变异系数变幅为9.07%-51.84%,果实色价与果皮和果肉的Lab值之间存在一定的相关性.20个SSR标记检测出107个多态性位点,平均每个标记5.1个;引物多态性信息含量(PIC)变幅为0.221-0.864,平均0.624;香农信息指数(I)和Nei's遗传多样性指数(H)平均值分别为1.3和0.646;57份辣椒种质遗传相似性系数变幅为0.069-0.915 1,平均0.294.系统聚类将57份种质划分为2个亚族,亚族Ⅰ和亚族Ⅱ分别包含28和29份种质,群体结构分析将种质划分为2个亚群,亚群Ⅰ和亚群Ⅱ分别有33和24份种质,与聚类分析结果交叉重叠度较高.利用GLM和MLM两种模型共检测到与辣椒果实颜色性状相关的16个标记,表型解释率为6.6%-13.8%;标记SSR4与果实色价极显著关联(P<0.01),标记SSR6、SSR9和SSR17在2种模型中均被检测到与同一性状显著关联.利用9对核心引物构建了57份辣椒种质的指纹图谱.[结论]对57份辣椒果实色价和Lab值的遗传多样性和基于SSR标记的遗传多样性进行综合分析,并构建种质指纹图谱,为辣椒种质资源鉴定、优异种质筛选及分子辅助育种提供了一定的理论依据.
关键词： 辣椒 果实颜色性状 SSR标记 遗传多样性 关联分析 指纹图谱
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国家地理标志保护产品-石柱辣椒
《长江蔬菜 》 2025
摘要：石柱县属中亚热带季风湿润气候区，生态环境质量优良，是辣椒生长的理想区域。近年来，石柱县不断加强辣椒新品种的选育与推广，持续推进辣椒产业向规模化、标准化、绿色化和品牌化发展。2016年，石柱辣椒获得农业农村部农产品地理标志登记认证，并入选“全国十大名椒”；“石柱红”牌辣椒获评绿色食品A级产品。目前，全县辣椒种植面积达6 700 hm2，产业效益显著，为促进农民增收发挥了重要作用。
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辣椒果实类胡萝卜素调控因子转录组和靶向代谢组分析
《园艺学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：分析了辣椒自交系1189不同发育时期果实转录组和类胡萝卜素靶向代谢组，基于加权基因共表达网络分析（weight gene co-expression network analysis,WGCNA）鉴定了可能参与调控辣椒类胡萝卜素生物合成相关基因的转录因子。靶向代谢组共鉴定出60种类胡萝卜素代谢物，分析发现，幼果期和绿熟期果实类胡萝卜素主要组分均为叶黄素（73.4%和64.5%），转色期叶黄素含量急剧下降，红熟期主要为辣椒红素（32.5%），无法检测到叶黄素。转录组分析共鉴定出14 148个差异表达基因和15个类胡萝卜素代谢相关差异表达基因。通过WGCNA将筛选所得的12286个差异表达基因划分至16个模块，发现MEdarkseagreen4、MElightcyan1和MEbrown2模块与11种主要类胡萝卜素组分显著相关。基于3个模块中类胡萝卜素相关差异表达基因构建代谢调控网络，并通过分析启动子结合基序，筛选出bHLH48、SEP3、CMB1、AGL27、YABBY2、GT-3B、NF-YA3、NAC2、HOX5和GATA26等10个转录因子可能在类胡萝卜素积累中发挥重要调控作用。
关键词： 辣椒 类胡萝卜素 转录组 靶向代谢组 加权基因共表达网络分析 转录因子
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50份加工型辣椒DH系苗期耐低温弱光综合评价
《中国蔬菜 》 2024 北大核心
摘要：以前期利用花药培养技术创制的50份加工型辣椒DH系为试验材料,以SPAD值、Fv/Fm、根系直径、茎叶干质量、根系干质量、整株干质量和根冠比7个指标的耐低温弱光指数为评价指标,采用模糊隶属函数和聚类分析法对其进行耐低温弱光综合评价.结果表明:50份DH系的耐低温弱光模糊隶属函数综合指数范围在0.20~0.76之间,聚类分析可将其分为两大类,根据耐低温弱光指数特点和模糊隶属函数综合指数可确定第Ⅱ类有7份DH系为耐低温弱光材料,即H201605-8、H201604-4-1、H201612-4-1、H201605-7、H201612-4、H201605-34和H201604-18.50份加工型辣椒DH系间耐低温弱光性差异较大,可作为相关机理研究的试验材料;筛选出的7份耐低温弱光DH系为培育适合设施栽培的优良辣椒新品种提供了材料基础,也为定向培育抗非生物逆境辣椒种质新材料提供了参考.
关键词： 辣椒 DH系 低温弱光 模糊隶属函数分析 聚类分析
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辣椒MADS-box转录因子CaRIN基因克隆、表达与功能分析
《西北植物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探究MADS-box家族基因RIN的表达特征和功能，解析其对辣椒类胡萝卜素代谢的影响。【方法】基于辣椒果实发育转录组，通过RT-PCR克隆辣椒MADS-box转录因子CaRIN基因CDS全长，分析其生物信息学、表达模式、亚细胞定位、转录活性等，并探讨VIGS诱导CaRIN基因沉默对类胡萝卜素代谢的影响。【结果】(1)CaRIN基因CDS全长732 bp,编码243个氨基酸，蛋白分子质量为27.95 kD,等电点(pI)为7.06,其编码蛋白具有典型的MEF2＿like MADS结构域，属MICK型转录因子。(2)CaRIN基因主要在花和果实中表达，具有组织特异性；CaRIN定位在细胞核，并且具有转录激活活性。(3)CaRIN基因启动子具有ABRE等多个激素应答元件，外源脱落酸和乙烯利均能加速果实转红，诱导CaRIN及相关基因高表达。(4)VIGS诱导沉默CaRIN基因后，类胡萝卜素代谢途径基因PSY1、CCS、PDS、CRTZ、LCYB和NCED1表达水平降低为对照组的0.27～0.59倍，且果实总类胡萝卜素含量(0.379 mg/g)较对照(0.650 mg/g)显著降低。【结论】CaRIN是辣椒果实类胡萝卜素代谢过程的重要调控因子。
关键词： 辣椒 MADS-box转录因子 CaRIN VIGS 类胡萝卜素
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“双碳”目标下低碳农业技术发展应用条件评价及路径研究
《西南大学学报（自然科学版） 》 2024 北大核心 CSCD
摘要："双碳"目标下,科学评估筛选适宜不同地域的农业减排固碳技术,并因地制宜制定低碳农业技术路径具有重要的现实意义.综合采取德尔菲法、层次分析法、多因素综合评价模型进行评价表明,种植、养殖、能源消耗3个方面42项技术中发展应用条件综合水平位于3≥Z≥2.5、 2.5>Z≥2、 2>Z≥1等3个区间的比重分别为16.67%,61.90%,21.43%,大部分技术在重庆具有较好的综合推广应用条件,其中种植方面最好;重庆低碳农业发展可采取分区分级思路,根据农业生产特点按粮食主产区、养殖集中区、生态脆弱区分区推进"双增双减""稳能减排""提能固碳"综合技术路径,根据技术发展应用条件水平分级优先推广位于3≥Z≥2.5区间的7项技术,以及位于2.5>Z≥2区间的26项技术.最后提出加快低碳农业技术的创新步伐、推广应用、发展环境建设等对策建议.
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氰氨化钙对连作辣椒根际土壤环境及植株生长发育的影响
《中国蔬菜 》 2024 北大核心
摘要：以加工型辣椒品种艳椒425为试材,采用大棚栽培方式,研究了氰氨化钙(CaCN2)不同施用量(0.3、0.6、0.9、1.2、1.5 t·hm-2)对连作辣椒根际土壤环境及植株生长发育的影响.结果表明:CaCN2 施用量为1.2 t·hm-2 和1.5 t·hm-2 时,连作辣椒根际的土壤孔隙度、饱和含水量、田间持水量、饱和导水率等土壤物理性质及碱解氮、有效磷、速效钾和有机质等土壤养分含量均显著高于不施用CaCN2 的CK,且保持了较高的土壤脲酶活性,土壤容重则比CK显著降低;辣椒结果盛期辣椒株高、开展度、单株结果数、果长及小区产量等两处理差异不显著,但均显著高于CK.随着CaCN2 施用量的增加,辣椒病害得到有效控制,CaCN2 施用量为1.2 t·hm-2 和1.5 t·hm-2 时,病株率分别仅为8.6%和5.5%,显著低于CK和其他处理.综上,CaCN2 施用量为1.2 t·hm-2 和1.5 t·hm-2 能有效降低连作辣椒的病株率,显著改善根际土壤环境,并对辣椒生长发育有良好的促进作用.综合考虑应用效果及生产成本,推荐CaCN2 施用量1.2 t·hm-2 用于缓解辣椒连作障碍.
关键词： 氰氨化钙(CaCN2) 辣椒 连作 土壤
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