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辣椒果实颜色性状与SSR分子标记的关联分析及指纹图谱构建

文献类型: 中文期刊

作者: 段敏杰 1 ; 李怡斐 1 ; 王春萍 1 ; 黄任中 1 ; 黄启中 1 ; 张世才 1 ;

作者机构: 1.重庆市农业科学院

关键词: 辣椒;果实颜色性状;SSR标记;遗传多样性;关联分析;指纹图谱

期刊名称: 生物技术通报

ISSN: 1002-5464

年卷期: 2025 年 41 卷 007 期

页码: 81-94

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: [目的]对辣椒种质材料进行遗传多样性分析,挖掘与果实颜色性状关联的分子标记.[方法]以57份辣椒种质为供试材料,利用7个果实颜色性状与20个SSR标记进行遗传多样性分析,使用Tassel 5.0软件的一般线性模型(GLM)和混合线性模型(MLM)进行SSR标记和性状的关联分析,并构建种质指纹图谱.[结果]7个果实颜色性状遗传多样性指数变幅为1.58(果皮L值)-2.08(果肉a值),变异系数变幅为9.07%-51.84%,果实色价与果皮和果肉的Lab值之间存在一定的相关性.20个SSR标记检测出107个多态性位点,平均每个标记5.1个;引物多态性信息含量(PIC)变幅为0.221-0.864,平均0.624;香农信息指数(I)和Nei's遗传多样性指数(H)平均值分别为1.3和0.646;57份辣椒种质遗传相似性系数变幅为0.069-0.915 1,平均0.294.系统聚类将57份种质划分为2个亚族,亚族Ⅰ和亚族Ⅱ分别包含28和29份种质,群体结构分析将种质划分为2个亚群,亚群Ⅰ和亚群Ⅱ分别有33和24份种质,与聚类分析结果交叉重叠度较高.利用GLM和MLM两种模型共检测到与辣椒果实颜色性状相关的16个标记,表型解释率为6.6%-13.8%;标记SSR4与果实色价极显著关联(P<0.01),标记SSR6、SSR9和SSR17在2种模型中均被检测到与同一性状显著关联.利用9对核心引物构建了57份辣椒种质的指纹图谱.[结论]对57份辣椒果实色价和Lab值的遗传多样性和基于SSR标记的遗传多样性进行综合分析,并构建种质指纹图谱,为辣椒种质资源鉴定、优异种质筛选及分子辅助育种提供了一定的理论依据.

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