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辣椒果实类胡萝卜素调控因子转录组和靶向代谢组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 段敏杰 1 ; 李怡斐 1 ; 王春萍 2 ; 杨小苗 1 ; 黄任中 1 ; 黄启中 1 ; 张世才 1 ;

作者机构： 1.重庆市农业科学院蔬菜花卉研究所

2.重庆市农业科学院生物技术研究所

关键词： 辣椒;类胡萝卜素;转录组;靶向代谢组;加权基因共表达网络分析;转录因子

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2024 年 008 期

页码： 1773-1791

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 分析了辣椒自交系1189不同发育时期果实转录组和类胡萝卜素靶向代谢组，基于加权基因共表达网络分析（weight gene co-expression network analysis,WGCNA）鉴定了可能参与调控辣椒类胡萝卜素生物合成相关基因的转录因子。靶向代谢组共鉴定出60种类胡萝卜素代谢物，分析发现，幼果期和绿熟期果实类胡萝卜素主要组分均为叶黄素（73.4%和64.5%），转色期叶黄素含量急剧下降，红熟期主要为辣椒红素（32.5%），无法检测到叶黄素。转录组分析共鉴定出14 148个差异表达基因和15个类胡萝卜素代谢相关差异表达基因。通过WGCNA将筛选所得的12286个差异表达基因划分至16个模块，发现MEdarkseagreen4、MElightcyan1和MEbrown2模块与11种主要类胡萝卜素组分显著相关。基于3个模块中类胡萝卜素相关差异表达基因构建代谢调控网络，并通过分析启动子结合基序，筛选出bHLH48、SEP3、CMB1、AGL27、YABBY2、GT-3B、NF-YA3、NAC2、HOX5和GATA26等10个转录因子可能在类胡萝卜素积累中发挥重要调控作用。

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