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玉米穗位高全基因组关联分析及其候选基因预测

文献类型： 中文期刊

作者： 李博 1 ; 张焕欣 2 ; 杨小艳 3 ; 吕颖颖 1 ; 江培顺 1 ; 郝转芳 2 ; 吕香玲 1 ; 王宏伟 1 ; 翁建峰 2 ;

作者机构： 1.沈阳农业大学农学院

2.中国农业科学院作物科学研究所/作物分子育种国家工程实验室

3.重庆市农业科学院生物技术研究中心

关键词： 玉米;穗位高;全基因组关联分析;元分析

期刊名称： 作物杂志

ISSN： 1001-7283

年卷期： 2013 年 02 期

页码： 27-32

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用41101个SNP标记对159份我国玉米自交系进行全基因组分析。通过控制群体结构和亲缘关系,采取混合线性模型,检测到7个与穗位高显著相关SNP(P<0.0001),并确定7个候选基因,其注释功能有GABA-B受体活性、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性、组蛋白-赖氨酸N-甲基转移酶活性、转运活性、翻译起始因子活性和酰胺基tRNA水解酶活性。利用BioMercator2-1软件将收集的137个穗位高QTL整合至IBM2 2008Neighbors玉米遗传图谱上,确定19个"一致性"QTL,结合分析7个与穗位高显著相关的SNP位点信息,获得2个候选基因。

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