科研产出
辣椒果实颜色性状与SSR分子标记的关联分析及指纹图谱构建
《生物技术通报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：[目的]对辣椒种质材料进行遗传多样性分析,挖掘与果实颜色性状关联的分子标记.[方法]以57份辣椒种质为供试材料,利用7个果实颜色性状与20个SSR标记进行遗传多样性分析,使用Tassel 5.0软件的一般线性模型(GLM)和混合线性模型(MLM)进行SSR标记和性状的关联分析,并构建种质指纹图谱.[结果]7个果实颜色性状遗传多样性指数变幅为1.58(果皮L值)-2.08(果肉a值),变异系数变幅为9.07%-51.84%,果实色价与果皮和果肉的Lab值之间存在一定的相关性.20个SSR标记检测出107个多态性位点,平均每个标记5.1个;引物多态性信息含量(PIC)变幅为0.221-0.864,平均0.624;香农信息指数(I)和Nei's遗传多样性指数(H)平均值分别为1.3和0.646;57份辣椒种质遗传相似性系数变幅为0.069-0.915 1,平均0.294.系统聚类将57份种质划分为2个亚族,亚族Ⅰ和亚族Ⅱ分别包含28和29份种质,群体结构分析将种质划分为2个亚群,亚群Ⅰ和亚群Ⅱ分别有33和24份种质,与聚类分析结果交叉重叠度较高.利用GLM和MLM两种模型共检测到与辣椒果实颜色性状相关的16个标记,表型解释率为6.6%-13.8%;标记SSR4与果实色价极显著关联(P<0.01),标记SSR6、SSR9和SSR17在2种模型中均被检测到与同一性状显著关联.利用9对核心引物构建了57份辣椒种质的指纹图谱.[结论]对57份辣椒果实色价和Lab值的遗传多样性和基于SSR标记的遗传多样性进行综合分析,并构建种质指纹图谱,为辣椒种质资源鉴定、优异种质筛选及分子辅助育种提供了一定的理论依据.
关键词： 辣椒 果实颜色性状 SSR标记 遗传多样性 关联分析 指纹图谱
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李资源果实主要性状的SSR标记关联分析及指纹图谱构建
《园艺学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：2022和2023年对收集的102份李资源的11个果实性状进行鉴定，其中单果质量的变异系数最大，可食率和果形指数的变异系数较小。利用78对多态性引物在供试材料中共扩增出405个等位变异，多态性信息含量（PIC）为0.06～0.80，平均值0.53。对SSR标记和11个主要性状进行关联分析，共检测到55个SSR标记与主要性状极显著关联，表型变异解释率为4.01%～14.76%。其中有29个标记在两年的GLM和MLM模型下，出现2次及以上与同一性状极显著关联。筛选出可区分102份供试材料的27对核心引物，并构建了102个李种质的指纹图谱。
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基于SCoT标记的芥菜种质遗传多样性与指纹图谱
《中国蔬菜 》 2013 北大核心
摘要：利用SCoT标记对46份芥菜种质资源进行遗传多样性分析.从70条引物中筛选出21条用于PCR扩增,共扩增出200条条带,其中多态性条带140条,多态性比率为70%.供试材料相似系数介于0.77~0.95之间,平均Nei's基因多样性为0.198,平均Shannon信息指数为0.301,平均多态信息含量为0.8227.利用UPGMA构建46份芥菜种质资源的聚类树状图,在相似系数D1=0.780处,可以将46份芥菜种质分为两大类;而在D2=0.807处,第Ⅱ类可进一步细分为5个亚类.选出清晰的16个多态性位点,构建46份芥菜种质的SCoT指纹图谱,结果由引物SP4、SP19、SP20、SP23、SP30所构建的DNA指纹图谱可将供试材料完全区分开.
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