基于SCoT标记的芥菜种质遗传多样性与指纹图谱

林清; 龙治坚; 韩国辉; 何桥; 向素琼; 范永红; 唐佳佳; 梁国鲁; 《中国蔬菜 》 2013 北大核心

摘要：利用SCoT标记对46份芥菜种质资源进行遗传多样性分析.从70条引物中筛选出21条用于PCR扩增,共扩增出200条条带,其中多态性条带140条,多态性比率为70%.供试材料相似系数介于0.77~0.95之间,平均Nei's基因多样性为0.198,平均Shannon信息指数为0.301,平均多态信息含量为0.8227.利用UPGMA构建46份芥菜种质资源的聚类树状图,在相似系数D1=0.780处,可以将46份芥菜种质分为两大类;而在D2=0.807处,第Ⅱ类可进一步细分为5个亚类.选出清晰的16个多态性位点,构建46份芥菜种质的SCoT指纹图谱,结果由引物SP4、SP19、SP20、SP23、SP30所构建的DNA指纹图谱可将供试材料完全区分开.

关键词： 芥菜 SCoT标记 遗传多样性 指纹图谱