玉米穗位高全基因组关联分析及其候选基因预测

李博; 张焕欣; 杨小艳; 吕颖颖; 江培顺; 郝转芳; 吕香玲; 王宏伟; 翁建峰; 《作物杂志 》 2013 北大核心 CSCD

摘要：利用41101个SNP标记对159份我国玉米自交系进行全基因组分析。通过控制群体结构和亲缘关系,采取混合线性模型,检测到7个与穗位高显著相关SNP(P<0.0001),并确定7个候选基因,其注释功能有GABA-B受体活性、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性、组蛋白-赖氨酸N-甲基转移酶活性、转运活性、翻译起始因子活性和酰胺基tRNA水解酶活性。利用BioMercator2-1软件将收集的137个穗位高QTL整合至IBM2 2008Neighbors玉米遗传图谱上,确定19个"一致性"QTL,结合分析7个与穗位高显著相关的SNP位点信息,获得2个候选基因。

关键词： 玉米 穗位高 全基因组关联分析 元分析