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重庆市萝卜芜菁花叶病毒的检测与序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 熊艳 1 ; 孙淼 2 ; 向华丰 2 ; 王鹤冰 2 ; 张洪成 2 ; 青玲 3 ;

作者机构： 1.重庆市农业科学院蔬菜花卉所;西南大学植物保护学院植物病害生物学重庆市高校级重点实验室

2.;重庆市农业科学院蔬菜花卉所;西南大学植物保护学院植物病害生物学重庆市高校级重点实验室

3.;重庆市农业科学院蔬菜花卉所;西南大学植物保护学院植物病害生物学重庆市高校级重点实验室;

关键词： 重庆市;萝卜;TuMV;CP基因;系统进化分析

期刊名称： 植物保护学报

ISSN： 0577-7518

年卷期： 2018 年 03 期

页码： 432-438

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为明确重庆市萝卜感染芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)的情况,在重庆市巴南区、九龙坡区、北碚区等14个区县共采集了146份萝卜病毒病样品,采用酶联免疫吸附试验法(enzymelinked immunosorbent assay,ELISA)对病样进行TuMV检测,并通过PCR、克隆和测序等技术获得13个TuMV分离物CP核苷酸序列,利用软件分析重庆市TuMV CP基因序列的相似性,利用系统进化树分析CP基因遗传变异与系统进化。结果表明,共有105份样品的TuMV检测为阳性,检出率为71.9%;所得13个分离物CP基因均为864 bp,测序的13个分离物CP核苷酸相似性为89.1%~99.2%,与国内已报道的TuMV各分离物CP核苷酸相似性在88.3%~99.4%之间;所得的13个分离物均分布在basal-BR和world-B组中,在Asian-BR和basal-B组中均无分布,进一步分析发现有9个分离物属于word-B组,仅4个分离物属于basal-BR组。研究表明,TuMV在重庆市萝卜各种植区普遍发生,且word-B组为重庆市萝卜的优势毒源。

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