文献类型： 中文期刊
作者： 洪林 1 ; 闫晓红 1 ; 李晨 1 ; 刘正富 2 ; 魏文辉 1 ;
作者机构： 1.中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学重点实验室
2.重庆市农业科学院果树研究所
关键词： 甘蓝型油菜;精氨酸脱羧酶(ADC)基因;同源克隆;序列分析
期刊名称： 南方农业学报
ISSN： 2095-1191
年卷期： 2012 年 43 卷 02 期
页码： 135-140
收录情况： CSCD
摘要： 【目的】克隆甘蓝型油菜精氨酸脱羧酶(ADC)基因的cDNA片段,为进一步获得ADC基因全长及研究其的生物学功能奠定基础。【方法】以甘蓝型油菜(Brassica napus L.)品种中双6号的花蕾为材料,设计简并引物,采用同源克隆法扩增ADC基因的cDNA片段。【结果】成功扩增获得8个不同的ADC基因拷贝,按长度将其分为1011、999、981bp3类,8个拷贝核苷酸序列之间的同源性为81%～99%,其推导氨基酸序列之间的同源性为86%～99%。1011bp片段包含3种不同的序列S1～S3,序列间存在9个单核苷酸多态性(SNP)位点。999bp序列包含S4和S5,具有3个SNP位点,两个区段出现连续碱基缺失。981bp序列包含S6～S8,发现14个SNP位点,且第67位核苷酸出现无义突变,4个区段发生碱基缺失。序列S4～S8共同缺失第632～634、642～650位的核苷酸小片段。氨基酸同源比对和系统进化分析结果表明,8个不同ADC基因拷贝与芥菜(Brassica juncea L.)、拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)、盐芥(Thellungiella halophila L.)等物种的ADC基因同源性高,亲缘关系近。【结论】所获得的8个基因拷贝即为来自于甘蓝型油菜ADC基因的片段。
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