科研产出
铁皮石斛SCoT-PCR反应体系的建立及其初步应用
《分子植物育种 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为建立铁皮石斛的SCoT-PCR反应体系,本研究以8个不同增殖代的铁皮石斛组培苗为试验材料,采用正交试验设计,对影响PCR反应体系的2×Taq Master Mix混合液、引物、模板DNA的浓度进行优化,建立了铁皮石斛SCoT-PCR的最佳反应体系,筛选引物,并对1～8代的组培苗进行遗传稳定性鉴定。结果表明:铁皮石斛的SCoT-PCR最佳反应体系（20μL）包含2×Taq Master Mix 10μL、引物0.50μmol/L、模板DNA 40 ng;从60条引物中筛选出19条扩增结果稳定、条带清晰的SCoT引物;所有引物在8个增殖代的16份供试材料中均能扩增出清晰、丰富而稳定的条带,但是所得条带的数量和大小一致,均没有多态性,即16份材料没有发生遗传变异。反应体系的建立可为铁皮石斛种质资源鉴定和遗传多样性研究提供参考,也为其他药用植物组培苗遗传稳定研究提供理论和方法借鉴。
关键词： 铁皮石斛（Dendrobium candidum Kimura et Migo） SCoT标记 组培苗 遗传稳定性
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樱桃种质SCoT分子标记与叶片表型性状关联分析
《园艺学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：利用本研究中建立的樱桃SCoT标记分析体系,进行适宜引物筛选,进而对12个樱桃品种进行SCoT分子标记、叶片表型性状遗传多样性及两者关联分析。结果显示:从102条SCoT标记引物中筛选出46条适宜樱桃遗传分析的标记引物,筛选率达45.1%;参试的18条SCoT引物共获得等位位点数77个,其中多态性位点65个,多态性比率84.4%;12个樱桃品种的表型叶片性状变异系数为11.49%～36.93%,叶片性状与SCoT标记聚类分析结果基本一致;Pearson’s相关分析表明,共有54个标记位点与12个性状呈显著或极显著相关;多元线性逐步回归分析获得了8个与叶片性状极显著相关的特异标记位点,解释了叶片性状47.8%～100.0%的变化;对8个关联标记进行序列比对分析,有5个标记能在樱桃基因组中找到同源序列,相似性均达75%以上,并能明确其染色体位置,其中4个标记能够在NCBI中比对到具有功能注释的同源序列,另3个标记未比对到同源序列。
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珍稀濒危植物距瓣尾囊草(Urophysa rockii Ulbr)SCoT-PCR分析体系的建立与优化
《分子植物育种 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：为研究距瓣尾囊草种质资源遗传背景和系统进化提供理论依据和技术支持,本研究利用L16(45)正交设计,研究Mg~(2+)等5个因素对PCR扩增结果的影响。研究结果表明,在距瓣尾囊草SCo T-PCR的最优反应体系(20μL)中,Mg~(2+)、d NTPs、Taq DNA聚合酶、引物以及模板DNA等5个因素的最优浓度分别是2.188 mmol/L、0.113 mmol/L、1.0 U、0.625μmol/L和30 ng。在此基础之上,从18条引物中初步筛选出12条扩增结果稳定、条带清晰的SCo T引物。建立了距瓣尾囊草SCo T-PCR反应体系,经过18条引物和13份种质资源的验证,证明体系稳定性好、可靠性高,能满足距瓣尾囊草分子水平上的研究。
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基于SCoT标记的芥菜种质遗传多样性与指纹图谱
《中国蔬菜 》 2013 北大核心
摘要：利用SCoT标记对46份芥菜种质资源进行遗传多样性分析.从70条引物中筛选出21条用于PCR扩增,共扩增出200条条带,其中多态性条带140条,多态性比率为70%.供试材料相似系数介于0.77~0.95之间,平均Nei's基因多样性为0.198,平均Shannon信息指数为0.301,平均多态信息含量为0.8227.利用UPGMA构建46份芥菜种质资源的聚类树状图,在相似系数D1=0.780处,可以将46份芥菜种质分为两大类;而在D2=0.807处,第Ⅱ类可进一步细分为5个亚类.选出清晰的16个多态性位点,构建46份芥菜种质的SCoT指纹图谱,结果由引物SP4、SP19、SP20、SP23、SP30所构建的DNA指纹图谱可将供试材料完全区分开.
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