葡萄OPR基因家族全基因组鉴定及重金属胁迫下的表达分析

游双红; 谭平; 史文景; 武峥; 陈元平; 伊洪伟; 周广文; 《基因组学与应用生物学 》 2021 北大核心 CSCD

摘要：12-氧-植物二烯酸还原酶（12-oxo-phytodienoic acid reductase, OPR）是十八烷碳烯酸代谢途径中的一个关键酶,控制茉莉酸合成的最后步骤。本研究从葡萄（Vitis vinifera L）基因组中鉴定了9个OPR家族成员基因,分别命名为VvOPR1～VvOPR9。利用生物信息学和分子生物学方法,对葡萄OPR家族成员的理化性质、进化特征、基因表达和结构以及其启动子元件、染色体定位等进行了分析。结果表明,9个VvOPR在系统发育树遗传进化关系上可分为两个亚组,组内进化相对保守;染色体定位发现该家族基因仅分布在11号和18号染色体上;基因结构分析显示VvOPRs结构高度保守,尤其是保守基序motif 6、motif4、motif2和motif3为所有基因共有;启动子分析显示,OPR基因的启动子区富含与生长发育、激素信号及逆境应答有关的顺式作用元件;荧光定量结果表明,VvOPR1、VvOPR2、VvOPR3、VvOPR7等4个基因在铜胁迫下表达量较高,推测它们可能参与了铜胁迫的应答。以上结果为今后进一步揭示葡萄VvOPR基因功能提供了重要的研究基础和理论依据。

关键词： 葡萄 OPR家族 全基因组鉴定 铜胁迫 表达分析