科研产出
基于SLAF-Seq技术的辣椒抗炭疽病QTL定位分析及SSR分子标记开发
《南方农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：【目的】利用SLAF-Seq技术对辣椒抗炭疽病QTL进行定位分析，开发与炭疽病抗性QTL紧密连锁的分子标记，为辣椒抗炭疽病分子标记辅助选择育种提供理论参考。【方法】以抗病材料PPTC26-3-1-1-1-1-1和感病材料1287为亲本构建F2代群体，并采用SLAF-Seq技术进行分子标记开发，构建高密图遗传连锁图谱。结合表型数据，利用复合区间作图法（CIM）对辣椒果实转色期的炭疽病抗性进行QTL分析。利用Microsatellite（MISA）在定位区间识别SSR位点。【结果】从亲本和子代样品共获得423351627条Reads，其中，来自PPTC26-3-1-1-1-1-1和1287分别为8130516和6621396条，F2代群体120个子代样品的平均Reads数量为34049987个。构建包含4671个SNP分子标记、分布于12个连锁群、总图距为1567.53 c M、平均图距为0.34 c M的辣椒高密度遗传图谱，检测到1个炭疽病抗性相关的QTL（Ca R10.1），位于10号连锁群上187930592～189766111 bp物理区间内。共有23个基因定位在关联区域内，根据基因功能注释，其中1个基因编码假定晚疫病抗性蛋白同源物R1B-23异构体X2,1个基因编码PPR蛋白，可能与辣椒果实转色期炭疽病抗性相关。在关联到的QTL区间内开发出SSR分子标记T482，在F2代群体中的验证结果显示，T482引物在F2代群体单株中扩增结果与表型鉴定结果一致。F2代群体抗病和中抗单株中有53株具有抗病亲本的条带，有25株同时具有抗病亲本和感病亲本的条带；F2代群体感病单株中，有42株具有感病亲本的条带。【结论】构建高密度遗传连锁图谱，将辣椒果实转色期炭疽病抗性定位于10号连锁群，在关联区间开发出SSR分子标记T482，可初步鉴别辣椒果实转色期炭疽病抗性，同时结合针刺接种法鉴定，可提高鉴定的准确率。
关键词： 辣椒 SLAF-Seq 遗传图谱 炭疽病 QTL SSR分子标记
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SCoT分子标记在茶树育种中的应用研究进展
《南方农业 》 2018
摘要：目标起始密码子多态性(Start Codon Targeted Polymorphism,SCoT)是一种可以与目标功能基因紧密连锁的目的基因标记,具有开发简单,成本低廉,稳定性和重复性好,多态性丰富,引物可在物种间通用等特点,已在多种植物中广泛应用。综述SCoT分子标记的原理及特点、引物设计、在茶树上的应用进展等方面,展望其在茶树指纹图谱构建和种质鉴定、差异基因表达分析、遗传连锁图谱构建方面的应用前景,以期为该标记在茶树中的深入应用提供更多参考。
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