科研产出
水稻几丁质酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析
《植物生理学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：几丁质酶是一种病程相关蛋白,不但在植物对病原菌和虫害的防御过程中发挥重要作用,也参与了植物对非生物胁迫的应答反应.然而,目前对几丁质酶在水稻应答各种生物和非生物胁迫的相关研究报道相对较少.利用BLASTP和隐马科夫模型(HMM),在水稻基因组中鉴定了49个几丁质酶基因,其中33个几丁质酶基因属于GH18亚家族,16个基因属于GH19亚家族,位于同一亚族的几丁质酶基因结构和保守基序组成相似.染色体定位分析表明,除了 12号染色体以外,水稻几丁质酶基因不均匀地分布在剩下的11条染色体上.53.06%(26/49)的水稻几丁质酶基因发生了复制,其中包括4对片段重复基因和18个串联重复基因.通过RNA-seq数据分析水稻几丁质酶家族基因在不同器官/组织中的表达模式,发现水稻几丁质酶家族基因具有明显的组织特异性表达模式.此外,大部分的几丁质酶基因在叶和/或根中的表达至少受到一种胁迫因子的诱导.总的来说,水稻几丁质酶基因家族的综合分析将有助于进一步了解几丁质酶基因在水稻生长发育中的作用.
全文链接
请求原文
葡萄OPR基因家族全基因组鉴定及重金属胁迫下的表达分析
《基因组学与应用生物学 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：12-氧-植物二烯酸还原酶（12-oxo-phytodienoic acid reductase, OPR）是十八烷碳烯酸代谢途径中的一个关键酶,控制茉莉酸合成的最后步骤。本研究从葡萄（Vitis vinifera L）基因组中鉴定了9个OPR家族成员基因,分别命名为VvOPR1～VvOPR9。利用生物信息学和分子生物学方法,对葡萄OPR家族成员的理化性质、进化特征、基因表达和结构以及其启动子元件、染色体定位等进行了分析。结果表明,9个VvOPR在系统发育树遗传进化关系上可分为两个亚组,组内进化相对保守;染色体定位发现该家族基因仅分布在11号和18号染色体上;基因结构分析显示VvOPRs结构高度保守,尤其是保守基序motif 6、motif4、motif2和motif3为所有基因共有;启动子分析显示,OPR基因的启动子区富含与生长发育、激素信号及逆境应答有关的顺式作用元件;荧光定量结果表明,VvOPR1、VvOPR2、VvOPR3、VvOPR7等4个基因在铜胁迫下表达量较高,推测它们可能参与了铜胁迫的应答。以上结果为今后进一步揭示葡萄VvOPR基因功能提供了重要的研究基础和理论依据。
全文链接
请求原文
功能性雄性不育茄子SmLOX基因的克隆与表达分析
《分子植物育种 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：本研究以茄子(Solanum melongena L.)功能性雄性不育系F13-1-7、T4和正常可育茄子142为材料,基于茄子基因组数据库,利用PCR方法克隆获得SmLOX基因的cDNA全长序列.结果表明,SmLOX基因的cDNA全长分别为2 557 bp,开放阅读框长度为2 508 bp,编码836个氨基酸,蛋白分子量为94.52 kD,理论等电点p I为5.3.进化树分析表明该基因与马铃薯、番茄的亲缘关系较近.亚细胞定位显示,Sm LOX蛋白N端均不含信号肽.定量分析发现,不育系中SmLOX的表达量都低于可育系,表明这个基因参与调控花药开裂过程.这为深入研究茄子功能性雄性不育和茄科植物花药开裂分子调控机制提供了一定的科学依据.
关键词： 茄子(Solanum melongena) 茉莉酸 LOX 基因克隆 表达分析
全文链接
请求原文
茄子3个Aux/IAA基因的克隆及表达分析
《园艺学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：以茄子单性结实品系‘D-7-1’为材料,克隆到3个新的Aux/IAA基因,分别命名为Sm IAA3、SmIAA4和Sm IAA9,其CDS长度分别为573、564和915 bp,分别编码190、187和304个氨基酸;系统进化树分析表明,3个蛋白均属于Aux/IAA家族蛋白,与番茄亲缘关系较近,且均具有Aux/IAA家族蛋白的DomainⅠ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ保守结构域;其分子量分别为21.50、20.95和32.67 k D,理论等电点分别为7.62、6.02和8.57。实时定量PCR分析表明:SmIAA9基因在单性结实和非单性结实品系茄子中的表达量差异明显,开花前单性结实品系的表达量显著高于非单性结实品系,推测其与茄子单性结实相关。
关键词： 茄子 单性结实 Aux/IAA 克隆 生物信息学 表达分析
全文链接
请求原文
首页上一页1下一页尾页
