科研产出
丝瓜根结线虫抗感品种的根际微生物群落比较分析
《四川农业大学学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探究丝瓜根结线虫与根际土壤微生物群落之间的关系，为探讨根结线虫与土壤微生物的关系提供了重要依据。【方法】首先对2个品种渝瓜砧（YGZ）和感病14(GB14)进行室内外抗性鉴定，然后利用高通量测序技术，分析了2个品种在根结线虫田间侵染发病初期的根际微生物多样性和结构组成。【结果】YGZ为高抗品种、GB14为感病品种，且与感病品种GB14相比，抗病品种YGZ根际细菌的多样性和丰富度较低、而真菌多样性和丰富度更高；在属水平上YGZ与GB14微生物群落的物种丰富度存在显著差异，例如镰刀菌属Fusarium丰富度YGZ较GB14低10.00%，芽孢杆菌属Bacillus YGZ较GB14高4.69%;2个品种的微生物物种组成也存在较大差异，YGZ和GB14独有的细菌物种分别为93个和245个、独有的真菌物种分别为91和70个。【结论】丝瓜根结线虫侵染危害对根际土壤细菌和真菌的种类组成和数量水平均有较大影响。
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基于高通量测序分析感染菌核病和健康桑果内生菌群落结构及多样性
《食品科学 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：以感染菌核病桑果和健康桑果为材料,采用Illumina MiSeq高通量测序,分析二者内生菌群落结构组成及多样性变化,充分挖掘桑果内生菌资源,探讨伴生菌与菌核病病原菌互作关系,为建立桑果微生物信息系统、桑果菌核病的病原学研究以及生物防治提供参考。结果表明:根据97%的序列相似性水平,可以将细菌和真菌分别归类为281个和259个非重复可操作分类单元（operational taxonomic units,OTU）。内生细菌群落以蓝藻门（Cyanobacteria）、变形菌门（Proteobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）、拟杆菌门（Bacteroidetes）为主,Cyanobacterianorank、Mitochondrianorank 2个细菌属在病果中呈明显下降趋势,敏感性较强。内生真菌群落以子囊菌门（Ascomycota）、Fungiunclassified、担子菌门（Basidiomycota）为主,Fungiunclassified、Basidiomycota受病原菌影响较大,其中Fungiunclassified几乎不存在于感病组,Basidiomycota下降99.07%。内生真菌多样性可明显划分感病果实和健康果实的界限,且感病果实内生真菌多样性远小于健康果实。LEfSe显著差异分析表明,泛菌属（Pantoea）是病果中重要的细菌类群,Ascomycota及其分支锤舌菌纲（Leotiomycetes）、柔膜菌目（Helotiales）、核盘菌科（Sclerotiniaceae）和杯盘菌属（Ciboria）,粪壳菌纲（Sordariomycetes）,座囊菌纲（Dothideomycetes）,炭角菌目（Xylariales）及其分支（XylarialesfXylarialesfamIncertaesedis,Monographella）是健康果实与感病果实间重要显著差异的生物标识。
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