重庆地区辣椒疫霉生理小种组成和群体遗传多样性分析

张世才; 张基林; 段敏杰; 杨小苗; 黄启中; 黄任中; 李怡斐; 罗云米; 《植物病理学报 》 2024 北大核心 CSCD

摘要：本研究采用平板对峙培养、鉴别寄主灌根接种和微卫星分子标记等方法，对2019和2020年采集自重庆市的66株辣椒疫霉（Phytophthora capsici）进行交配型、生理小种组成和群体遗传多样性分析。交配型检测结果显示A1交配型有13株，A2交配型有53株。生理小种鉴定结果显示42株P.capsici中有11株race1、28株race2、1株race3和2株race6（超级毒性小种）。利用6个已报道的微卫星分子标记位点对所有P.capsici菌株进行群体变异分析，共计获得59个不同的基因型；来自重庆地区11个P.capsici地理群体的有效等位基因数Ne为1.786～2.881,期望杂合度He为0.352～0.577,Shannon-Wiener指数H为1.242～2.079,多态标记百分率为83.33%～100%,群体之间的基因交流频繁（Nm=0.133～7.680）,总群体的遗传分化处于中等水平(F_ST=0.113)。以上结果表明P.capsici在重庆各区县的遗传变异程度不同，总群体内杂合子过剩，具有丰富的遗传多样性。各地理群体的交配型组成、固定系数以及Hardy-Weinberg平衡和连锁不平衡检验提示重庆地区P.capsici可能同时存在无性和有性繁殖。AMOVA分析结果显示遗传变异主要来自群体内部。主成分分析（DAPC）表明重庆地区P.capsici菌株间存在明显差异，可划分为2个类群。Structure分析显示重庆地区P.capsici可能来自两个不同的祖先群体。上述有关重庆地区P.capsici有性生殖、生理小种组成和群体遗传结构等方面的研究结果为该地区辣椒疫病的防控奠定了基础。

关键词： 辣椒疫霉 生理小种 遗传多样性 群体结构