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资源类型: 中文期刊
关键词:生物信息学(模糊匹配)
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茄子3个Aux/IAA基因的克隆及表达分析

园艺学报 2015 北大核心 CSCD

摘要:以茄子单性结实品系‘D-7-1’为材料,克隆到3个新的Aux/IAA基因,分别命名为Sm IAA3、SmIAA4和Sm IAA9,其CDS长度分别为573、564和915 bp,分别编码190、187和304个氨基酸;系统进化树分析表明,3个蛋白均属于Aux/IAA家族蛋白,与番茄亲缘关系较近,且均具有Aux/IAA家族蛋白的DomainⅠ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ保守结构域;其分子量分别为21.50、20.95和32.67 k D,理论等电点分别为7.62、6.02和8.57。实时定量PCR分析表明:SmIAA9基因在单性结实和非单性结实品系茄子中的表达量差异明显,开花前单性结实品系的表达量显著高于非单性结实品系,推测其与茄子单性结实相关。

关键词: 茄子 单性结实 Aux/IAA 克隆 生物信息学 表达分析

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水稻高叶绿素含量基因DET1 cDNA的克隆、生物信息学分析及超表达载体的构建

中国生物工程杂志 2010 北大核心 CSCD

摘要:提高水稻叶片中叶绿素含量可以提高光合作用效率。以水稻高叶绿素含量突变体为材料,在前期精细定位的基础上,克隆了高叶绿素含量基因DET1(DE-ETIOLATED1)cDNA。测序结果显示:DET1基因全长cDNA为1536bp,由11个外显子组成,编码512个氨基酸。与野生型珍汕97B相比,DET1基因在第7个外显子上有T-C的转换,该转换引入了一个EcoRI酶切位点,并导致第328位的亮氨酸(L)改变为丝氨酸(S),且突变位点处于高度保守区域内。DET1基因的氨基酸序列与玉米等其它高等植物的氨基酸序列同源性高达62%以上。利用生物信息学方法对DET1基因的序列、进化树、理化性质及亲疏水性等进行分析,并构建了水稻超表达载体pCUPHN-DET1,为水稻高叶绿素含量突变基因DET1的功能验证奠定基础。

关键词: 水稻 叶绿素 DET1 生物信息学 超表达载体

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