科研产出
李资源果实主要性状的SSR标记关联分析及指纹图谱构建
《园艺学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：2022和2023年对收集的102份李资源的11个果实性状进行鉴定，其中单果质量的变异系数最大，可食率和果形指数的变异系数较小。利用78对多态性引物在供试材料中共扩增出405个等位变异，多态性信息含量（PIC）为0.06～0.80，平均值0.53。对SSR标记和11个主要性状进行关联分析，共检测到55个SSR标记与主要性状极显著关联，表型变异解释率为4.01%～14.76%。其中有29个标记在两年的GLM和MLM模型下，出现2次及以上与同一性状极显著关联。筛选出可区分102份供试材料的27对核心引物，并构建了102个李种质的指纹图谱。
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樱桃种质SCoT分子标记与叶片表型性状关联分析
《园艺学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：利用本研究中建立的樱桃SCoT标记分析体系,进行适宜引物筛选,进而对12个樱桃品种进行SCoT分子标记、叶片表型性状遗传多样性及两者关联分析。结果显示:从102条SCoT标记引物中筛选出46条适宜樱桃遗传分析的标记引物,筛选率达45.1%;参试的18条SCoT引物共获得等位位点数77个,其中多态性位点65个,多态性比率84.4%;12个樱桃品种的表型叶片性状变异系数为11.49%～36.93%,叶片性状与SCoT标记聚类分析结果基本一致;Pearson’s相关分析表明,共有54个标记位点与12个性状呈显著或极显著相关;多元线性逐步回归分析获得了8个与叶片性状极显著相关的特异标记位点,解释了叶片性状47.8%～100.0%的变化;对8个关联标记进行序列比对分析,有5个标记能在樱桃基因组中找到同源序列,相似性均达75%以上,并能明确其染色体位置,其中4个标记能够在NCBI中比对到具有功能注释的同源序列,另3个标记未比对到同源序列。
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镉胁迫下甜、糯玉米开花期性状的全基因组关联分析
《植物遗传资源学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：以183份甜、糯玉米自交系构成的关联群体为材料,在2种Cd污染水平下对甜、糯玉米开花期（DA,days to anthesis）、吐丝期（DS,days to silking）和开花吐丝间隔（ASI,anthesis silking interval）进行全基因组关联分析,以揭示重金属Cd胁迫对甜、糯玉米开花期的影响及调控基因。结果表明:不同Cd污染水平对甜、糯玉米DA和DS均产生影响,其中对DS的延长更为明显,从而导致ASI的增大。同时,甜玉米ASI平均值高于糯玉米ASI,由此表明甜玉米ASI对重金属Cd胁迫更为敏感。结合群体基因型和开花期相关性状表型的全基因组关联分析,分别筛选到3个开花期相关的SNP位点和6个吐丝期相关的SNP位点。根据其所对应的物理位置与Maize GDB和NCBI基因数据库进行比对,预测获得8个已知功能基因,其中包括在前人研究中与玉米开花期有关的候选基因。以上研究解析甜、糯玉米在重金属Cd污染水平下开花期及吐丝期的遗传规律,为今后开展甜、糯玉米分子标记辅助育种和Cd安全品种的选育提供参考。
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