科研产出
一株高产吲哚乙酸的Bacillus cereus YT2-1C的鉴定及促生作用
《生物技术通报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：【目的】分析高产吲哚乙酸的YT2-1C菌株促生抑菌潜力，为其后续开发利用提供基础。【方法】通过菌株形态特征、16S rRNA和31个看家基因比对结果对菌株进行鉴定，定量测定菌株IAA的产量，分析菌株在产铁载体、溶磷、解钾、产蛋白酶、固氮和抑菌方面的潜力。进一步通过育苗和田间试验验证菌株的促生效果，并从基因组水平初步分析了菌株与促生相关的功能基因。【结果】YT2-1C菌株鉴定为蜡样芽胞杆菌（Bacillus cereus），该菌株IAA产量高达193μg/mL，具有产铁载体、溶磷、产蛋白酶和抑菌的能力。育苗试验结果表明，接种YT2-1C菌株的基质，显著增加黄瓜、辣椒和番茄的株高、叶绿素、茎粗和鲜重；黄瓜移栽田间后，仍有较好的促生作用。全基因组测序分析表明YT2-1C菌株具有54个与促生相关的基因，5个非核糖体肽合成相关的基因。【结论】蜡样芽胞杆菌YT2-1C是一株具有促生防病功能的菌株，对黄瓜、辣椒和番茄有显著的促生作用，含有多个与促生防病相关基因，为其微生物菌剂的研制奠定了基础。
关键词： 促生菌 蜡样芽胞杆菌 菌株YT2-1C IAA 育苗基质 全基因组测序
全文链接
请求原文
耐草甘膦菌株Pantoea rodasii S1536全基因组测序及比较基因组分析
《基因组学与应用生物学 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：耐草甘膦菌株泛菌属S1536 (Pantoea rodasii S1536)是从草甘膦污染土壤中分离筛选出来的一种革兰氏阴性菌,对草甘膦的抗性能高达400 mmol/L.本研究首次通过PacBio RSII平台对泛菌属S1536进行全基因组测序,使用SMRT portal软件对reads进行组装,获得10个contigs,最终获得高质量且无间隔的泛菌属S1536基因组包含1条染色体和2个质粒,序列全长为5.16 Mb,其GC含量为55.16%.本研究进一步对基因组序列进行基因预测与功能注释、COG和GO聚类分析,预测了次级代谢产物合成基因簇及草甘膦抗性机制,最终得到编码基因有4 843个,4 656个蛋白获得COG功能注释,预测到2个NRPS类基因簇、1个thiopeptide类基因簇和1个hserlactone-arylpolyene类基因簇.莽草酸代谢途径关键酶EPSP合酶基因分析表明,泛菌属S1536中的EPSP合酶属于ClassⅠ型EPSPS.根据已报道的3株同一种Pantoea rodasii strain ND03、Pantoea rodasii strain DSM 26611和Pantoea rodasii strain LMG 26273的基因组信息进行全基因组关联比较分析,结果显示4株菌虽然属于同一种,但在进化中产生了较大差异.相关研究结果将为泛菌属S1536功能基因组学研究、耐除草剂机制的研究及耐除草剂基因的挖掘提供基础数据.
全文链接
请求原文
首页上一页1下一页尾页
